蛋白质是生命活动的关键执行者，它们的功能丰富多样，从催化生化反应到构建细胞结构，都离不开蛋白质的参与。因此，探究蛋白质的结构与功能对于生物学、医学以及生物技术等多个领域来说至关重要。蛋白质序列，也就是氨基酸序列，是理解蛋白质功能和结构的关键。本文将介绍几种获取蛋白质序列的方法。

一、数据库查询

随着蛋白质组学的发展，许多在线数据库提供了丰富的蛋白质序列信息。这些数据库通常包含已知蛋白质的序列数据、功能注释、结构信息等。用户可以通过关键词搜索或使用特定的标识符（如基因名、蛋白质ID）来查找所需的蛋白质序列。 常用的蛋白质数据库包括：

1.UniProt（Universal Protein Resource）：提供详尽的蛋白质资料，涵盖序列、高级结构、功能说明、翻译后修饰信息及文献引用等。此外，还能够提供一个去除冗余信息、包含多种物种蛋白质组的数据库。

2.NCBI Protein Database（National Center for Biotechnology Information Protein Database）：美国国立生物技术信息中心所提供的蛋白质数据库，广泛覆盖了众多物种。此外，该数据库还支持序列相似性搜索，使得科学家能够快速找到与特定蛋白质序列相似的其他蛋白质，进而进行功能预测和结构分析。

二、基因序列预测

对于尚未被收录在数据库中的蛋白质，可以通过其对应的基因序列进行预测：

1.获取DNA/RNA序列：通过实验方法（如测序）或数据库查询获得目标基因的核苷酸序列。

2.翻译成蛋白质序列：利用生物信息学工具，如BLAST、ExPASy Translate等，将DNA或mRNA序列翻译成相应的氨基酸序列。

3.序列校验与优化：翻译后的蛋白质序列可能需要进一步的分析和校正，以确保准确性。例如，去除信号肽、确定正确的起始和终止位点等。

三、实验测定

对于新发现的蛋白质，或者在现有数据库中找不到相应信息的情况下，可以采用实验方法直接测定蛋白质序列。常用的技术包括：

1.基于Denovo的蛋白质从头测序分析：是一种基于LC-MS/MS的高精度的分析技术，能够准确解析蛋白质的序列，从而推断出氨基酸序列。

2.Edman降解法：通过逐步去除蛋白质N端的氨基酸并鉴定其类型来实现序列测定。

蛋白质序列的获取途径多种多样，既可以通过检索现有的生物信息学数据库迅速获得，也可以通过实验手段或计算预测来揭示新的蛋白质序列。随着科技的不断进步，未来预计将开发出更多高效且精确的方法，为蛋白质研究提供更坚实的支持。无论选择哪种方法，关键在于确保数据的精确性和可信度，以便更有效地服务于科学研究和实际应用。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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